Вместе с тем, что отель постоянно занимается сохранением биологического разнообразия морских вод, по специальному проекту Shangri-La был открыт Морской заповедник, направленный на сохранение природных богатств.
В Shangri-La's Mactan Resort and Spa, Cebu Морской заповедник Shangri-La был официально основан в 2007 году, на сегодняшний день он занимает шесть гектаров курортного побережья. В нем обитают более 160 видов рыб, моллюсков и кораллов.
Сотрудники курорта и руководящий состав постоянно занимается уборкой и чисткой побережья, ведет программы подводной уборки и восстановления кораллов. Было затоплено два корабля с целью создания искусственных коралловых рифов и увеличения количества рыб.
Поддержку Морскому заповеднику Shangri-La оказывают также патронирующие организации-партнеры Amores Charities, Inc. и Scotty's Action Sports Network.
